Avec WinBooks, l'encodage analytique est découplé de l'encodage dans la comptabilité générale. Cette façon de travailler offre énormément de souplesse mais peut faire apparaître des discordances, volontaires ou involontaires, entre les imputations en comptabilité générale et analytique.

La liste des documents à compléter aussi appelée liste de contrôle analytique détecte ces discordances. C'est un document très important pour s'assurer de la parfaite synchronisation entre la comptabilité générale et analytique. Il donne, par période, et par journal, la liste des pièces comptables non imputées analytiquement, mais également au sein d'une pièce comptable imputée analytiquement les éventuelles discordances : différence entre le total de l'imputation comptable, et sa contrepartie analytique.